马来西亚森林研究所最近更新了马来西亚红树林的数据。沙巴州有大约马来西亚红树林总面积的61%，超过63万公顷。沙捞越红树林占总面积的22%，余下红树林位于马来西亚半岛。自1990年以来，共约20,000公顷，大概是总面积3%的红树林消失了，尤其是在室外永久性森林保护区或者国有土地内的。红树林覆盖面积减少的主要原因是转为其他土地用途，其他因素如海岸侵蚀和污染也影响了红树林生长。